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                广东省微生〓物研究所 广东省微生物菌种保藏中心▃发起共建全球模式菌株№库(GTSB)的倡议书

                  微生物菌种资源是重要的战略资源,与人类健康和生态安全息息相关。深度发掘、共享和利用微生物资源对生命科学研究和生物产业技∩术创新具有重要意义。目前☆普遍认为仅有1%-5%的微生物被分离鉴□ 定,部分学者甚至认为已知的微生※物仅占十万分之一(Locey & Lennon,2016),绝大多数微生物◤仍未被发现和分离鉴定。新物种蕴含着新的遗传资源及生理代谢机制,并具有巨大的开发应用潜力,因此探索和发掘微生物新物→种仍是当今微生物学领域重要的科学任务。     

                  微生物的系统分类是建立以界、门、纲、目、科、属、种为不同阶元等级的鉴别体系,反映微生物的系统进化关系,“种”(Species)是该体系最基↓本的分类单位。模式菌株(Type strain)是在首次正式描述和命名微生物物种时所使用的、活的纯培▲养物,是作为分类的实物依据和准则。根据国际原核生物命名法(International Code of Nomenclature of Prokaryotes,ICNP),所有新命名的可培养微︻生物,都必须指定一个模式菌株,并作∑为公共资源,同时保存到2个国家和/或地区的菌种保藏中心。     

                  模式菌株通常是同一微生物物种中生物学特征描述最清晰的菌株,具⌒ 有唯一性和参考性,是一类特殊的微生物△资源。根据LPSN(List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature)(Parte,2018)官方网站统计,截至2020年6月,依照国际原核生物命名法有效发表的微生物共19527种(https://lpsn.dsmz.de/text/numbers),这些已知物种的模式菌株广泛分布在全球各公共菌种保藏中心,其中比较重要和著名的菌种保藏中心包括德国微生物菌种保▼藏中心(German Collection of Microorganisms and Cell Cultures,DSMZ)、日本微生物菌种保●藏中心(Japan Collection of Microorganisms,JCM)和美国典型菌种保藏中心(American Type Culture Collection,ATCC)等。国家微生物资源平台数据显示,目前我国共有模式菌株3673株(http://nimr.org.cn/moshijunIndexAction.action),主要集中在中国普通微生物菌种保藏管理中ㄨ心(China General Microbiological Culture Collection Center,CGMCC)和中国典型培养物保藏中心(China Center for Type Culture Collection,CCTCC)。广东省微生物菌种保藏中心(GuangDong Microbial Culture Collection Center,GDMCC)和其他专业菌种保藏中心亦有一定数量的保存。     

                  中国学者对微生物分类学发展贡献巨大。自2011年起,中◥国成为世界上每年发表微生物新种最多的国家(Sant'Anna et al., 2020)。随着微生物ξ 分离与培养新方法、新技术的︽不断出现,越来越多的微生物新资源将被发现,意味着需要更多数量的模式菌株用于对比实验研究。中ぷ国学者从国外保藏机构获取模式菌株,要受到《生物多「样性公约》、《名古屋议定书》、当事国生物遗传资源管理法规、菌种保藏中心材料转移协议(MTA)以及国际贸易和运输条件等诸多因素的约束,需要耗费研究者大量的时间和精力,甚至有些菌株难以从国际保藏机构获取,严重影响了我国微生物分类学研究∩工作的开▓展。     

                  为了提高模式菌株的可获得性,进一步促进模式菌株的长期安全保藏和开放共享,广东①省微生物研究所和广东微生物菌种保藏中心拟联合》国内外微生物资源同行发起共建全□球模式菌株库(Global Type Strain Bank,GTSB)行动,致力于:(1)通过合法途径实现散在模式菌株资源的整合;(2)搭建大规模、高质量的模式菌株实物库;(3)开发模式菌株全分类指标标准信息库;(4)模式菌株№实物和信息的公益共享。通过GTSB行动,提升模式菌株的可获得性,促进我国微▅生物分类学研究的发展。     

                  广东省微生物菌种保藏中心(WDCM编号953)成立于1987年,是国际认可的模式菌株保藏机构和《布达佩斯条约》国际保藏单位(International Depositary Authority,IDA),现已建成︻拥有普通微生物菌种库、专利ζ菌种库和13个专业菌种库的大型微生物资源中心,保藏菌种23000多株,覆盖了农业、工业、环境、分析和食药用菌等领域,并具有显著的热带亚热带特色,长期为社会各界提供高效的菌♂种资源共享和鉴定等服务。中心现△有工作人员66名,保藏库面积ζ 2300多平方米。近年来,中心积极开展模式菌株的收集、整理、保藏和共享工作,现存各类模式菌株1089株。中心愿借本次公益行动,继续做好微生物资源』的保藏与共享服务工作,将为全球模式菌株》库(GTSB)提供专门︾的资源保藏空间和设施(保藏库面积约1000平方米),使用3种以上的方式进行资源的长期安全保藏。     

                  广东省微生物菌种保藏中心将在《生物多样性公约》和《名古屋议定书》框架下,积极与模式菌株的原︽始保藏人和相关保藏机构联系,在严格遵守相关法律法规和充分尊重知识产权的基础上,实现更多的模式菌株资源的整合与公益性◥共享。欢迎国内∏学者将待发表模式菌株保存在我中心,中心将提供免费全基因组草图测序服务,同时也将按保藏菌株数量的2倍为保藏人免费提供库藏的其它模式菌株。     

                  让我㊣ 们共同携手,建设全球模式菌株库,更好地服◥务中国微生物资源学研究。     

                  真诚▆期待您的参与!     

                  本倡议得到了邓子新院士、吴※清平院士、张偲院士、沈建忠院士、陈坚院士、陈卫院士、任发政院◢士、杨瑞馥卐研究员、东↑秀珠研究员、姜瑞波研究『员、程池教授和赵斌教授的大力支持!     

                  有意参加共建的单位和专家可以发邮件至 gtsb@xianbt.com,或电话联系邓㊣名荣(13760724481)、冯广达(13760649653)。

                   

                     

                  广东↘省微生物研究所   广东省微生物菌种保藏中心

                           2020年6月26日

                   

                  

                  全球模式菌株库(GTSB)共建行动指导专家委员会

                  邓子新院士  吴清╳平院士  张偲院士  沈建忠院士  陈坚院士  陈卫院士  任发政院士  杨瑞馥研究╲员  东秀珠研究员  姜瑞波研究员  程池教授  赵斌教授     

                  全球模式菌株库(GTSB)共建行动监督专家委员会

                  主  任:吴清平院士

                  副主任:朱红惠 邵宗泽 李文均 许学伟

                  委  员(按姓氏首字母〖排序):

                  曹毅  陈波  陈冠军  承磊  崔恒林  杜宗军  邓宇  郭文超  何健  何山  李猛  李越中  刘波  全哲学  唐蜀昆  田新朋  万一  王韧  王玮  王正祥  王治业  韦革宏  吴敏  杨红  姚粟    姚青   张惠文  张利莉  张维  张晓华  郑世学  周剑平

                  秘  书:邓名荣  冯广达     

                  目前,已有来自以下单ξ位的专家支持并愿意参与全球模式菌株库(GTSB)共建行动:

                  (按单位名称首字母排序)

                  北京科技大学

                  北京市农林科学院

                  大连民族大学

                  东卐北农业大学

                  复旦大学

                  福建农林大学

                  福建省农业科学院

                  甘肃省科学院生物研究所

                  广东省林业科学研究院森林保护研究所

                  广东省农业科学院植物Ψ 保护研究所

                  广西民族大学

                  国科现代农业产业科技创新研究院

                  哈尔滨工业◤大学(威海)

                  海南大学

                  河海大学

                  湖北省工业微生物菌种保藏与研究中心

                  湖南大学

                  华南理工大学

                  华南农业大学

                  华智生物技术有限公司①

                  华中农业⊙大学

                  华中师范大学

                  暨南大学

                  江南大学

                  江苏大学

                  江苏海洋大学

                  江西省农业科学院农业应用微生物研究所

                  军事医学科学院

                  南方医科大学

                  南方医科∞大学珠江医院

                  南开大学

                  南京农业大学

                  南京工①业大学

                  南通大学

                  南阳师范学院

                  内蒙古大学

                  宁波大学

                  农业农村部沼气科学研究所

                  山东大学(青岛)

                  山东大学(威海)

                  山东农业大学

                  上海交通大学

                  陕西省科学【院陕西省微生物研究所

                  深圳大学

                  深圳国家基因库

                  四川大学

                  四川省微生物资源平台菌种保藏管理中心

                  四川省食品发酵工业研究设计院

                  塔里木大学

                  天津工业大学●○

                  西北农林科技大学

                  西藏农牧学院

                  厦门大学

                  新疆农业科╲学院微生物应用研究所↓

                  新疆师范大学

                  云南大学云南省微生物研究所

                  浙江大学

                  浙江农林大学

                  浙江理工大学

                  郑州大学

                  郑州轻工业大〒学

                  中山大学

                  中国海洋大学

                  中国工业菌种保藏管理中心

                  中国海洋微生物菌种保藏管理中心

                  中国极地研究中心

                  中国科学院城市☆环境研究所

                  中国科学院南海¤海洋研究所

                  中国科学院昆明植物研究所

                  中国科学院沈阳应用⌒ 生态研究所

                  中国科学院烟台海岸带研究所

                  中国农业大学

                  中国农业科学院麻类研究所

                  中国农业科学院生物技术研究所

                  中国农业科学院※烟草研究所

                  中国食☆品发酵工业研究院

                  仲恺农业工程学院

                  中粮营养健康研究院

                  自然资源部第二海洋研究所

                  自然资源部第三海洋研究所   

                  

                  参考文献

                  1. Locey, K.J. & Lennon, J.T. Scaling laws predict global microbial diversity. Proc Natl Acad Sci USA. 2016. 113(21):5970-5975.

                  2. Sant'Anna FH, Reiter KC, Fátima Almeida P, Pereira Passaglia LM. Systematic review of descriptions of novel bacterial species: evaluation of the twenty-first century taxonomy through text mining. Int J Syst Evol Microbiol. 2020. 70(4):2925-2936.

                  3. Parte, AC. LPSN — List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (bacterio.net), 20 years on. Int J Syst Evol Microbiol. 2018. 68(6):1825-1829.  

                  


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