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                【中国科学报】广东省科学院微生物研究所完成白肉灵芝基「因组测序

                              

                        本报讯(记者朱汉ぷ斌 通讯员李诚斌)近日,中国工程院院士、广东省科学院微〗生物研究所名誉所长吴清平团队完成了白肉灵芝的全基因组测序。据悉,这是世界上首次对白肉灵芝的基因组进@ 行组装和注释。相关研究发表于《G3:基因,基因组,遗传学》。

                  白肉灵芝是在中国发现的灵芝科一新种,具有多种药理活性。作为我国具有鲜明地域特色的野生资源,白肉灵芝目前已成为科□技扶贫和带动一方经济发展的重︻要资源,在中国西南地区广泛种植。但由于缺乏参考基因组,其遗传研究受到〇了阻碍。

                  研』究人员从一个单核菌株中提取了高质量的DNA,并基于Illumina和Nanopore平台组装完→成第一个白肉灵芝全基因组。组装的基因组※大小为50.05Mb,N50为3.06Mb,预测到78206条编码序列和13390个基因。

                  此外,研究人员分析了白肉灵芝和灵芝之间次级代谢产物▲(萜类化合物)的功能基因的差异。研究发现,与灵芝相比『,白肉灵芝具有更多与萜类化合物合成相关的基因,这可能是它们表现出不同生物活★性的原【因之一。

                  据吴清平团队成员胡惠萍介绍,白肉灵芝基因组是目前组装质量最好的灵芝属物种。该成果为今后特定物种的高原适应性深层研究奠定了基础。

                  相关∮论文信息:https://doi.org/10.1093/g3journal/jkab337

                                                                                          《中国科学报》 (2021-11-12 第4版 综合)


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